A cada seu hi ha un director o directora, i uns col·laboradors responsables de les diferents àrees organitzatives.
Junts conformen l’Assemblea local, que es reuneix com a mínim un cop al mes. L’Assemblea General, amb tots els seus socis, es reuneix com a mínim un cop a l’any.

La seva estructura associativa garantitza el respecte a la diversitat, l’autonomia i la iniciativa de cada un dels seus integrants. El seu funcionament permet que la seva acció es desenvolupi amb total independència d’interessos polítics, religiosos o financers a cada un dels més de 50 països on es troba. Uneix esforços, aporta condicions concretes de desenvolupament interior i exterior i estimula la iniciativa ciutadana cap a la responsabilitat cívica i al voluntariat social.

D’acord amb els seus Estatuts, la Junta Directiva de l’Associació Internacional està integrada per un representant de cada una de les Associacions federades. Entre els seus membres més qualificats són escollits els integrants de Consell Executiu Internacional, que s’encarrega de coordinar i realitzar els contactes necessaris, per portar a terme els acords establerts en cada reunió anual de l’Assemblea.

Des de 1992, la presidència de l’Organització Internacional està a càrrec de na Delia Steinberg i Guzmán. Al 2005 es va nomenar a na Beatriz Diez-Canseco i Bustamante com a Presidenta Adjunta.

Nova Acròpolis es troba censada al:

- Registre internacional d’associacions de Bèlgica (nº 48, pàg. 4489)
- Ministeri de l’Interior.
- Registre Nacional d’associacions (nº 14741)
- Ministeri de Medi Ambient. Cens d’Entitats d’Educació Ambiental.
- Cens d’entitats de la Subdirecció General d’Associacions de Voluntariat de la Generalitat de Catalunya (nº 1469).
- Cens d’entitats juvenils, Generalitat de Catalunya. Secretaria de Joventut.
- Fitxer General d’entitats ciutadanes. Directori d’Associacions de l’Ajuntament de Barcelona.
- Cens d’entitats ambientals UNESCOcat.