En cada sede hay un director o directora, y unos colaboradores responsables de las diferentes áreas organizativas. Juntos conforman la Asamblea local, que se reúne como mínimo una vez al mes. La Asamblea General, con todos los socios, se reúne como mínimo una vez al año.

Su estructura asociativa garantiza el respecto a la diversidad, la autonomía y la iniciativa de cada uno de sus integrantes. Su funcionamiento permite que su acción se desarrolle con total independencia de intereses políticos, religiosos o financieros en cada uno de los más de 50 países en que se encuentra. Une esfuerzos, aporta condiciones concretas de desarrollo interior y exterior y estimula la iniciativa ciudadana hacia la responsabilidad cívica y el voluntariado social.

De acuerdo con sus Estatutos, la Junta Directiva de la Asociación Internacional está integrada por un representante de cada una de las Asociaciones federadas. De entre sus miembros más cualificados son elegidos los integrantes del Consejo Ejecutivo Internacional, que se encarga de coordinar y realizar los contactos necesarios, para llevar a término los acuerdos que se establecen en cada reunión anual de la Asamblea.

Desde 1992, la presidencia de la Organización Internacional está a cargo de Delia Steinberg Guzmán. En 2011 se ha nombrado a Giorgios Alvarado Planas como Presidente Adjunto.

Nueva Acrópolis se encuentra censada en:

- Registro internacional de asociaciones de Bélgica (nº 48, pág. 4489)

- Ministerio del Interior.
Registro Nacional de asociaciones (nº 14741)

- Ministerio de Medio Ambiente. Censo de Entidades de Educación Ambiental.

- Censo de entidades de la Subdirección General de Asociaciones de Voluntariado de la Generalitat de Catalunya (nº 1469).

- Fichero General de entidades ciudadanas. Directorio de Asociaciones del Ayuntamiento de Barcelona.

- Cens d’entitats ambientals UNESCOcat.

Delia Steinberg Guzmán, actual presidenta de la Organización Internacional Nueva Acrópolis